1915年，洛克菲勒基金会下属的罗氏驻华医社（China Medical Board）买下了北京原有的协和医学堂，第二年又在东单北面购得清代豫亲王府的旧址，准备在这里建设一所新的医学院。王府的旧建筑被拆除，1917年新校舍奠基，1921年9月落成。落成典礼持续了一周，中外医学界人士在典礼期间举行学术报告，基金会的主持人小约翰·D·洛克菲勒（John D. Rockefeller Jr.）专程出席。
主持学院的是美国医生霍顿（Henry S. Houghton），他在任期间确立的学制和规章，本刊人物志另有专文介绍。本文写协和这所机构本身。
绿瓦下的医学院
协和的校舍由美国建筑师何士（Harry Hussey）设计，是一组中国宫殿式的建筑群：绿色琉璃瓦的歇山屋顶，檐下施彩画，底部是汉白玉栏杆和台基。建筑内部则完全按照当时美国医学院和医院的标准建造，有实验室、教室、病房、手术室、图书馆，以及自备的锅炉房、电力和供水设施。建设费用远远超出了最初的预算。
用中国宫殿式建筑包裹现代医学院，是洛克菲勒方面有意的选择，意在表示这所学院要在中国扎根。同一时期，燕京大学、金陵女子大学等教会大学的校园也采用了类似的做法。
科研
协和的定位是培养医学教育和研究的领导人才，科研在学院中占有重要地位。1920年代到1930年代，协和的几个基础医学系在国际学术界有相当的声誉。
生物化学系的吴宪与美国导师福林（Otto Folin）合作提出的血液分析方法，被称为福林—吴法，长期在临床检验中使用；他在1931年提出的蛋白质变性理论，也是这一领域的早期重要成果。生理学系主任林可胜是新加坡出生的华人，1926年发起成立中国生理学会，创办《中国生理学杂志》。抗战期间，林可胜组织中国红十字会救护总队，总部设在贵阳图云关，训练了大批战地救护人员。
解剖学系主任、加拿大人步达生（Davidson Black）研究周口店出土的古人类牙齿化石，1927年将其命名为「中国猿人北京种」。1929年，协和与中国地质调查所合作设立新生代研究室，同年12月，裴文中在周口店发现第一个完整的北京猿人头盖骨。这批化石此后一直保存在协和，1941年太平洋战争爆发前后，在准备运往美国的途中下落不明，至今没有找到。
公共卫生
协和的另一项重要事业是公共卫生。公共卫生学系的兰安生（John B. Grant）认为，中国最迫切的问题是传染病和婴儿死亡率高，单靠医院治疗远远不够，必须建立基层的卫生服务。1925年，协和与北京的警察机关合作，在东城设立公共卫生事务所，后来通称第一卫生事务所，负责一个街区内居民的出生死亡登记、预防接种、妇幼保健和学校卫生，也是协和学生的公共卫生实习基地。
协和毕业生陈志潜后来到河北定县，参加晏阳初主持的中华平民教育促进会的乡村建设实验，建立了村、区、县三级的农村卫生保健体系，由经过短期训练的村民担任村保健员。这套办法后来被看作中国农村基层卫生制度的一个先例。
协和医院也是北京城里许多知名人物就医的地方。1925年初，孙中山在协和医院接受手术，确诊为肝癌晚期，随后移居铁狮子胡同的行馆，3月12日去世。1926年，梁启超在协和做了肾切除手术，术后病情没有好转，引起社会上对协和和西医的批评，梁启超本人撰文为协和辩护。
中国人主持的协和
1928年霍顿离任后，协和按国民政府的规定立案，由中国人出任院长。第一位中国籍院长刘瑞恒是哈佛大学医学博士，曾任协和医院院长，他在出任协和院长的同时，还先后担任国民政府卫生部次长、卫生署署长，把协和的人员和经验带进了国家卫生行政。1930年代，南京的中央卫生设施实验处和各地的卫生机构中，有不少人出自协和。协和内科教授张孝骞1937年回到湖南，出任湘雅医学院院长，抗战中率领湘雅辗转迁往贵阳、重庆。
护士学校与毕业生
协和1920年开办护士学校，招收受过大学预科教育的女生，培养高水平的护理人员和护理教师，这在当时的中国十分少见。医学院每年毕业的人数很少，从1924年第一届到1943年，总共只有三百多名毕业生，但其中许多人后来成为各地医学院和医院的骨干。妇产科医生林巧稚1929年毕业，获得当年毕业生的最高奖，此后长期在协和工作。
战争与接管
1941年12月8日太平洋战争爆发，日军占领了协和医学院和医院，学校停办，美籍人员被拘押。协和的教师和毕业生分散到各地，有的到大后方的医学院任教，有的在北平开设私人诊所。战争期间，护士学校的一部分师生辗转到成都复课。
抗战胜利以后，罗氏驻华医社筹备复校，1947年重新招生，医院也逐步恢复。1951年1月，中央人民政府接管协和医学院，与洛克菲勒方面的关系结束。此后学校几经改名和改组，今天的北京协和医院仍在东单原址，当年的绿瓦建筑大部分保存完好。
年表
- 1915年 罗氏驻华医社收购协和医学堂。
- 1917年 新校舍奠基。
- 1920年 护士学校开办。
- 1921年 9月新校舍落成。
- 1925年 公共卫生事务所设立；孙中山在协和医院就医。
- 1929年 新生代研究室设立；北京猿人头盖骨发现。
- 1941年 太平洋战争爆发，协和停办。
- 1947年 复校招生。
- 1951年 由中央人民政府接管。
